Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF330Q9Y3S2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF330Q9Y3S2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms