Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX24Q9Y343 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms