Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BTRCQ9Y297 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms