Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SHANK2Q9UPX8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SHANK2Q9UPX8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms