Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIAA1024Q9UPX6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIAA1024Q9UPX6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIAA1024Q9UPX6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIAA1024Q9UPX6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIAA1024Q9UPX6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIAA1024Q9UPX6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIAA1024Q9UPX6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIAA1024Q9UPX6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIAA1024Q9UPX6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIAA1024Q9UPX6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1024Q9UPX6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIAA1024Q9UPX6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms