Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP22Q9UPT9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms