Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTF2Q9UNY4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms