Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNPO2Q9UMS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNPO2Q9UMS6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms