Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKLN1Q9UL63 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms