Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PNMA3Q9UL41 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA3Q9UL41 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms