Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSPAN16Q9UKR8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms