Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC23Q9UJX2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms