Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCP2D1Q9UJQ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms