Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATPIF1Q9UII2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms