Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO40Q9UH90 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms