Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOBEC3BQ9UH17 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3BQ9UH17 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms