Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFC0

LRWD1, Leucine-rich repeat and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRWD1Q9UFC0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRWD1Q9UFC0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
LRWD1Q9UFC0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRWD1Q9UFC0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRWD1Q9UFC0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRWD1Q9UFC0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRWD1Q9UFC0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRWD1Q9UFC0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms