Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLKQ9UBT6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms