Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK4Q9UBT3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms