Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC6Q9UBN7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC6Q9UBN7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms