Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms