Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN10Q9UBB4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN10Q9UBB4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms