Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMC3IPQ9P2W1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms