Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
REREQ9P2R6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms