Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDH10Q9P2E7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms