Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD7Q9P2D1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms