Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL20A1Q9P218 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms