Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC47.75■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC47.73■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC47.73■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC47.73■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.72■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC47.72■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC47.71■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC47.71■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC47.7■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC47.7■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC47.7■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.69■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC47.69■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC47.68■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC47.68■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC47.68■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC47.68■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.67■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.66■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.65■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC47.65■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.65■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.65■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC47.64■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC47.64■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC47.64■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC47.64■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC47.63■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC47.63■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC47.63■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
CCDC180Q9P1Z9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC47.63■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC47.62■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC47.62■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC47.62■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC47.6■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.6■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.6■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC47.6■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC47.6■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC47.6■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC47.6■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC47.59■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.59■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC47.59■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC47.59■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC47.59■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.57■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
CCDC180Q9P1Z9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC47.56■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC47.56■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC47.56■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.55■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC47.55■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.55■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC47.55■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC47.54■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC47.52■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC47.52■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms