Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms