Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFNKQ9P0W0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms