Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDE1Q9NZC3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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