Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms