Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms