Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A4Q9NY91 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A4Q9NY91 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A4Q9NY91 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A4Q9NY91 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A4Q9NY91 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms