Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms