Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TDP1Q9NUW8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDP1Q9NUW8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
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