Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACER3Q9NUN7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms