Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG3Q9NT62 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG3Q9NT62 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms