Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms