Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LTBP3Q9NS15 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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