Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HELLSQ9NRZ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HELLSQ9NRZ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HELLSQ9NRZ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HELLSQ9NRZ9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HELLSQ9NRZ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HELLSQ9NRZ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HELLSQ9NRZ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HELLSQ9NRZ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HELLSQ9NRZ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HELLSQ9NRZ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HELLSQ9NRZ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELLSQ9NRZ9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms