Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMPRSS4Q9NRS4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms