Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO4Q9NRQ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms