Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD93Q9NPY3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms