Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNB1IP1Q9NPC3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms