Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms