Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE7BQ9NP56 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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