Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPV4Q9HBA0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms