Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms