Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SENP3Q9H4L4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SENP3Q9H4L4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SENP3Q9H4L4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SENP3Q9H4L4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms